روشی جدید برای تشخیص لوسمی میلوژنیک و لنفوسیتیک حاد با استفاده از داده های بیان ژن و روش های یادگیری ماشین

نویسندگان

رباب شیخ پور

r. sheikhpour گروه تربیت بدنی، واحد تفت، دانشگاه آزاد اسلامی، تفت، ایران و مرکز تحقیقات خون و انکولوژی، دانشگاه علوم پزشکی شهید صدوقی، یزد، ایران، راضیه شیخ پور

r. sheikhpour دانشگاه یزدسازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی شهید صدوقی یزد (shahid sadooghi university of medical sciences) مهدی آقا صرام

m. aghasaram دانشگاه یزدسازمان اصلی تایید شده: دانشگاه یزد (yazd university)

چکیده

چکیده سابقه و هدف لوسمی از سرطان­های شایع در جهان است. یکی از مهم ترین روش­ها برای کشف و پیش­بینی لوسمی میلوژنیک و لنفوسیتیک حاد، استفاده از dna افراد و اطلاعات ژنتیکی آن ها می باشد. تکنولوژی ریز آرایه، ابزاری برای بررسی بیان هزاران ژن در حداقل زمان است. تحلیل مجموعه داده های ریز آرایه بدون کمک آنالیز آماری و روش های یادگیری ماشین ممکن نیست. در این مطالعه با استفاده از مجموعه داده های ریز آرایه و روش های یادگیری ماشین به تشخیص انواع لوسمی پرداخته شد. مواد و روش ها داده های مورد استفاده در این پژوهش توصیفی، بیان 7129 ژن مربوط به 72 بیمار مبتلا به لوسمی بود که با استفاده از فناوری ریز آرایه به دست آمد. سپس با استفاده از این داده ها، تشخیص لوسمی میلوژنیک حاد(aml) و لوسمی لنفوسیتیک حاد(all) با روش طبقه بندی ناپارامتری هسته، تابع پایه شعاعی ناهمسانگرد با استفاده از معیارهای نسبت بهره و بهره اطلاعاتی انجام شد. یافته ها روش پیشنهادی طبقه بندی ناپارامتری با استفاده از معیار بهره اطلاعاتی با انتخاب230 ژن مهم و با استفاده از معیار نسبت بهره با انتخاب 86 ژن مهم با دقت 06/97٪ ، قادر به تشخیص انواع لوسمی میلوژنیک و لنفوسیتیک است، در حالی که روش طبقه بندی ناپارامتری هسته ، تابع پایه شعاعی با 7129 ژن دارای دقت 29/35٪ است. نتیجه گیری نتایج این مطالعه نشان داد که استفاده از داده های بیان ژن و روش پیشنهادی با معیار نسبت بهره قادر به تشخیص لوسمی با دقت بالایی است. بنابراین به نظر می رسد این روش می تواند در تشخیص دقیق­تر انواع لوسمی کمک کند تا تصمیمات مناسب تری در مورد نحوه تشخیص و درمان بیماران گرفته شود.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

روشی جدید برای تشخیص لوسمی میلوژنیک و لنفوسیتیک حاد با استفاده از داده‌های بیان ژن و روش‌های یادگیری ماشین

چکیده سابقه و هدف لوسمی از سرطان­های شایع در جهان است. یکی از مهم‌ترین روش­ها برای کشف و پیش­بینی لوسمی میلوژنیک و لنفوسیتیک حاد، استفاده از DNA افراد و اطلاعات ژنتیکی آن‌ها می‌باشد. تکنولوژی ریز آرایه، ابزاری برای بررسی بیان هزاران ژن در حداقل زمان است. تحلیل مجموعه داده‌های ریز آرایه بدون کمک آنالیز آماری و روش‌های یادگیری ماشین ممکن نیست. در این مطالعه با استفاده از مجموعه داده‌های ر...

متن کامل

مقایسه تأثیر وضعیت طاق باز و دمر بر وضعیت تنفسی نوزادان نارس مبتلا به سندرم دیسترس تنفسی حاد تحت درمان با پروتکل Insure

کچ ی هد پ ی ش مز ی هن ه و فد : ساسا د مردنس رد نامرد ي سفنت سرتس ي ظنت نادازون داح ي سکا لدابت م ي و نژ د ي سکا ي د هدوب نبرک تسا طسوت هک کبس اـه ي ناـمرد ي فلتخم ي هلمجزا لکتورپ INSURE ماجنا م ي دوش ا اذل . ي هعلاطم ن فدهاب اقم ي هس عضو ي ت اه ي ندب ي عضو رب رمد و زاب قاط ي سفنت ت ي هـب لاتـبم سراـن نادازون ردنس د م ي سفنت سرتس ي لکتورپ اب نامرد تحت داح INSURE ماجنا درگ ...

متن کامل

تشخیص لوسمی لنفوسیتی و میلوئیدی حاد با استفاده از انتخاب ژن داده های ریز آرایه و الگوریتم های داده کاوی

چکیده سابقه و هدف تکنولوژی ریزآرایه، یک تصویر کلی از میزان بیان هزاران ژن به طور هم زمان ارایه می دهد. تفسیر داده های ریز آرایه بدون آنالیز آماری و روش های هوش مصنوعی ممکن نیست. هدف این مقاله، تشخیص انواع لوسمی حاد با استفاده از مجموعه داده های ریز آرایه و الگوریتم های داده کاوی بود. مواد و روش ها در این مطالعه توصیفی از داده های بیان 7129 ژن مربوط به 72 بیمار مبتلا به لوسمی استفاده شد. سپس با ...

متن کامل

تشخیص لوسمی لنفوسیتی و میلوئیدی حاد با استفاده از انتخاب ژن داده‌های ریز‌آرایه و الگوریتم‌های داده کاوی

چکیده سابقه و هدف تکنولوژی ریزآرایه، یک تصویر کلی از میزان بیان هزاران ژن به طور هم زمان ارایه می‌دهد. تفسیر داده‌های ریز آرایه بدون آنالیز آماری و روش‌های هوش مصنوعی ممکن نیست. هدف این مقاله، تشخیص انواع لوسمی حاد با استفاده از مجموعه داده‌های ریز آرایه و الگوریتم‌های داده ‌کاوی بود. مواد و روش‌ها در این مطالعه توصیفی از داده‌های بیان 7129  ژن مربوط به 72 بیمار مبتلا به لوسمی استفاده شد. سپس ...

متن کامل

بیان ژن Survivin در بیماران لوسمی پرومیلوسیتیک حاد در زمان تشخیص و بعد از مصرف دارو

  چکید ه   سابقه و هدف   Survivin (SVV) یک مهار کننده آپوپتوز است که بیان آن در اکثر سرطان‌ها بالا رفته و با مقاومت به شیمی درمانی، افزایش عود بیماری و کاهش بقای بیمار همراه است. هدف در این پژوهش، بررسی بیان ژن ‌ SVV در مراحل مختلف بیماری در بیماران APL ( Acute Promyelocytic Leukemia ) بود.   مواد و روش‌ها   در یک مطالعه مورد ـ شاهدی، نمونه خون 50 بیمار APL مراجعه کننده به مرکز تحقیقات خون، انک...

متن کامل

بررسی بیان ژن های CCDC26 و C-Kit در رده های سلولی لوسمی لنفوبلاستیک حاد

Background and Aim: Acute Lymphoblastic Leukemia is the most common cancer in children and is one of the main causes of their mortality. In this study, we examined the expression of long noncoding RNA CCDC26 gene and its downstream C-Kit gene in acute lymphocytic Leukemia cell line. Materials and Methods: This is an experimental study. In this study, the acute Lymphoblastic Leukemia cell lines...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
فصلنامه پژوهشی خون

جلد ۱۳، شماره ۳، صفحات ۲۰۷-۲۱۴

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023